All’interno del corridoio sono esposti reperti archeologici di epoca romana, capitelli medievali ed opere pittoriche. Particolarmente interessanti sono il Fronte di sarcofago clipeato con scene di libagione, reperto databile al II secolo d.C, e la bellissima pala del XVI secolo raffigurante la Madonna del Rosario, recentemente restaurata.

Nella sala sono custoditi affreschi che, malgrado il loro stato frammentario, rivestono una considerevole importanza per la storia dell’arte locale. Staccati già prima del 1923, i dipinti provengono da un ambiente sovrastante l’attuale Cappella della Madonna del Pianto, che corrisponde all’antica abside sinistra della Cattedrale, separata dal resto della chiesa con gli interventi  progettati da Galeazzo Alessi nel XVI secolo.

La sala è dominata dal quattrocentesco Polittico di San Rufino, opera del pittore folignate Nicolò di Liberatore detto l’Alunno. L'opera è stata recentemente restaurata con il sostegno della Fondazione Cassa di Risparmio di Perugia.
Nella predella sono raffigurate le storie del martirio del santo patrono di Assisi, del miracoloso ritrovamento del suo corpo e del trasferimento delle sue spoglie mortali all’interno delle mura della città.

La sala contiene anche arredi provenienti da oratori delle confraternite cittadine ed alcuni splendidi gonfaloni processionali, il più antico dei quali risale al 1378 ed apparteneva alla Confraternita di San Francesco o delle Stimmate. Gli interessanti affreschi visibili sulla parete a destra dell’ingresso, realizzati dal giottesco Puccio Capanna e da Pace di Bartolo, furono strappati dall’Oratorio della Confraternita di San Rufinuccio.
Di pregevole fattura nella sala è, infine, il gonfalone dipinto dall’artista pisano Orazio Riminaldi (1593-1630) per la Confraternita di Santa Caterina, che mostra -da un lato- il Martirio della Santa titolare del pio sodalizio e -dall’altro- le splendide figure dei Santi Giacomo ed Antonio Abate.

La sala, dominata dal trono vescovile del XVIII secolo,  ospita arredi sacri, paramenti e alcune pregevoli opere d'arte.

Le sale contengono reperti e opere d’arte provenienti dal territorio della Diocesi, come l’edicola di Matteo da Gualdo (Gualdo Tadino 1430/35 ca. -1507) raffigurante la Madonna col Bambino e i Santi Antonio Abate e Francesco d’Assisi

Secondo quanto si narra nel sermone di San Pier Damiani, dopo aver assistito ai numerosi miracoli avvenuti quando il sarcofago che aveva contenuto il corpo di San Rufino venne trasportato nella “parva basilica”, il vescovo Ugo decise di costruire una nuova e più grande chiesa in onore del patrono della città nello stesso luogo in cui, probabilmente a partire dall’VIII secolo, riposavano le sue spoglie mortali.
Della Basilica Ugoniana restano attualmente la torre campanaria, il chiostro dei Canonici e la Cripta. Quest’ultimo ambiente fu rimesso alla luce nel 1895 dal canonico Giuseppe Elisei, il quale lo fece liberare dal materiale che all’epoca ne occludeva l’accesso.
La cripta è divisa in tre navate con abside e con volte a crociera sorrette da colonne collegate da arcate.
La porta originale che conduceva alla navata della Basilica Ugoniana è visibile all’inizio del percorso, se si accede dalla chiesa. Sulla sinistra si può notare un fregio dorico a metope e triglifi con un cane, due delfini e un kantharos (coppa per bere): questo frammento è uno dei tanti elementi e rilievi di età romana inseriti nelle pareti della cripta.
Elementi di spoglio di epoca romana in travertino e in pietra calcarea rosa del Subasio reimpiegati nella costruzione medievale sono anche sei capitelli, sei colonne e due basi all’interno della cripta. Quattro dei suddetti capitelli sono ionici e risalgono ad un periodo compreso tra la fine del II secolo e la prima metà del I secolo a.C.; gli altri due sono invece corinzi, uno a foglie lisce e l’altro non finito, databili tra il IV e il V secolo d.C.
Il sarcofago collocato al centro dell’abside è, per l’appunto, quello che secondo la tradizione per lungo tempo aveva ospitato le spoglie di San Rufino, la cui effige venne dipinta sul retro del manufatto nel 1556 da Raffaello Coda. Realizzato in marmo bianco, il sarcofago, che può essere datato attorno al III secolo d.C., è lavorato ad altorilievo e sul fronte presenta il Mito di Selene ed Endimione.
Nella parete absidale, in origine probabilmente decorata a fresco con una Teoria di Santi, resta soltanto una figura frammentaria che un’iscrizione (oggi purtroppo scomparsa) identificava come San Costanzo, protovescovo e patrono di Perugia. Sulla volta campeggiano i simboli dei quattro Evangelisti (l’angelo di san Matteo, il leone di San Marco, il toro di San Luca e l’aquila di San Giovanni), databili alla metà dell’XI sec.

Del suggestivo chiostro dei Canonici, risalente all’XI secolo, restano archi gemini sorretti da sottili colonnine e capitelli dalla caratteristica forma trapezoidale, detti a stampella, molto diffusi nell’architettura medievale. Il pozzo racchiuso tra le arcate, tradizionalmente denominato “Pozzo della Mensa”, è invece di epoca romana ed è profondo ben 35 metri.

Le opere esposte in questa sala  furono donate alla Diocesi di Assisi dallo storico dell’arte e collezionista statunitense Frederick Mason Perkins (Hingham, 1874 – Assisi, 1955). Conservata per molti anni in deposito temporaneo al Sacro Convento, la raccolta è stata esposta per la prima volta al pubblico nel 2006 all’interno del nuovo Museo Diocesano. Da non perdere, la Santa Caterina di Plautilla Nelli e la tavola del XIV secolo raffigurante la Dormitio Virginis che, trafugata dalle truppe naziste il 3 luglio 1944 dalla Villa di Sassoforte a Lastra a Signa, è stata recentemente recuperata dai Carabinieri del Comando Tutela Patrimonio Culturale di Monza e restituita alla collezione.

I pannelli che corrono lungo le pareti della suggestiva saletta medievale adiacente al chiostro narrano, attraverso le ricostruzioni in 3D e tramite i reperti ospitati nelle teche sottostanti, il culto femminile della divinità umbro -picena Cupra/Arenta/Bona Mater, i sacrifici e i rituali ad esso legati e la storia del santuario pagano che si ergeva dove oggi è situata la Cattedrale.

Dalla mostra emerge chiaramente che il santuario pre-urbano (IV – III sec. a.C.) di Asisium dedicato a Cupra Mater occupava un luogo strategico, al crocevia di percorsi che collegavano l’entroterra montano alle valli dei fiumi Chiascio (Clitumnus) e Tevere. Il piccolo edificio sacro era un importante luogo d’incontro e di scambio per le comunità sparse nel territorio. Santuario emporico situato in un’antica via di transito umbro-picena, era un luogo in cui affluivano idee, costumi, lingue, riti e conoscenze tecniche di popolazioni diverse. In esso era verosimilmente presente anche un centro scrittorio che offriva i propri servizi ai frequentatori, sia per le dediche votive sia per gli accordi commerciali.

Aperta al pubblico a novembre del 2014, la sala conserva oggetti di uso liturgico, argenterie – tra le quali spicca il pregevole Busto reliquiario settecentesco di San Rufino, realizzato dall’argentiere romano Paolo Spagna – e una serie di tele attribuibili al pittore umbro Cesare Sermei (Città della Pieve, 1581 – Assisi, 1668). Il dipinto raffigurante San Francesco morente che benedice la città di Assisi, eseguito dall’artista per il Palazzo Vescovile, è stato recentemente restaurato e collocato all’interno della sala.

La Sala Esposizioni è, di recente, diventata la nuova sede dell'Archivio.

Il complesso archivistico conservato presso il Capitolo della Cattedrale di San Rufino, tra cui si segnalano, tra l'altro, 4 pergamene anteriori all'anno 1000, si è formato, inizialmente, con la sedimentazione di materiale strettamente connesso alla vita del Capitolo stesso.
A partire dagli anni Trenta del Novecento, vi sono pervenuti anche documenti afferenti a confraternite e parrocchie cittadine. 

Per informazioni e prenotazioni scrivere a archiviovescovile@gmail.com